>>Если Цитадель "спусковой крючок" системы защиты, нафига отдавать ее в руки органиков?

Чтобы они его спустили.

>>Если у вас стотыщмиллионов кораблей, которые на голову превосходят все, что органики могли построить, то зачем нападать на центральные планеты столь незначительными силами, что органики успешно обороняются и даже наносят вам невосполнимые потери?

Да ладно, три-четыре корабля - это не так, чтобы потери.

>>Если цель таки состоит в том, чтобы предовтратить уничтожение органических рас Искусственным Интеллектом

Я бы сказал, что цель состоит в том, чтобы периодически "подрезать" органиков и не давать им оборзеть вконец.